17 марта 2003 года уже исполнилось 700 лет, как погиб святой благоверный правитель Даниил Московский. Во время его правления, которое длилось с 1276 по 1303 года, в Москве образовался княжеский престол, давший возможность городу стать более самостоятельным и процветающим. Княжество Даниила сделало его величественным родоначальником Московских князей.
При жизни великого князя Василия ІІІ, который был сыном Ивана ІІІ, случилось грандиозное событие. Как-то раз он со своими подданными проезжал возле места погребения Даниила Московского. И тогда Иван Шуйский, бывший боярином князя Василия, упал с коня и не мог сесть в седло обратно. Он решил, что легче всего стать на надгробный камень Даниила и таким образом залезть на лошадь. Проходившие мимо люди всячески отговаривали его от этого, но Иван оказался упрямым и стал на камень, занося ногу на седло. Как же были удивлены присутствующие, когда конь резко встал на дыбы и замертво упал на землю, попутно придавив Шуйского. Боярин едва избежал смерти после того, как на месте погребения помолились священнослужители. Стоит отметить, что это не единственный чудесный случай. Когда правил могущественный Иван Грозный, многие ставали свидетелями волшебного исцеления умирающего на Данииловой могиле. Тогда царь установил ежегодный крестный ход к этому месту, чтобы проводить службу панихиды.
Силами Ивана Грозного был отреставрирован старинный Даниловский храм, отдан приказ построить и освятить новую соборную церковь в честь Семи Вселенских Соборов, а также поселить в отреставрированный храм иноков. Вдобавок построили монастырскую стену, которая преобразовала обычную церквушку в неприступную крепость. Через некоторое время это пригодилось здешним жителям. В начале 1606 года силами князя Скопина-Шуйского была проведена великолепная военная операция, в течение которой все боевые полки спрятались в стенах монастыря, а позже неожиданно окружили противника.
Далее пришло время Смуты для Даниловского монастыря. Тогда поляки его разворовали и чуть не уничтожили. Выжила церковь благодаря инвестициям царей, чтивших память своих предков. Нашествие поляков не было единственной невзгодой в жизни святыни. В 1812 году его оккупировали вражеские войска Наполеона, которые забрали все сокровища и уничтожили несущие стены. Новую беду Ставропигиальная церковь встретила с приходом большевиков, которые изгоняли священнослужителей, не разрешая им читать молитвы и пропагандировать религию.
Старинный Даниловский храм закрыли лишь в конце 1930 года, одним из последних в России. Вместе с закрытием были украдены и святые мощи Даниила Московского. Только в 1983 году, по решению советской власти, собор снова отдали московским патриархам, чтобы устроить там официальную резиденцию. На сегодняшний день здесь можно увидеть резиденцию Святейшего Патриарха, где проводят Архиерейские соборования Русской Православной Церкви.
Легенда повествует, что 1652 года явился царю Алексею Михайловичу во сне князь Даниил. Тогда правитель в августе того года приказал патриарху Никону вскрыть гробницу князя. Так православные верующие обрели нетленные и чудотворные мощи. Они были перенесены в храм, где разместили их в гробницу из дерева. А князь был приобщен к лику святых.